Knit Rmd → HTML（项目高频场景）

目标

Knit/render R Markdown (.Rmd) to HTML reliably in this repo (auto-bootstrap pandoc, set correct knit_root_dir, and run rmarkdown::render via a Python wrapper).

当用户说"knit 出 html / render Rmd / 生成 HTML 报告"时使用本 skill。

版本由 config.yaml:skill_info.version 统一管理。

流程

输入

输入为待渲染的 .Rmd 路径；可选输入包括项目根目录、输出文件路径、Pandoc 版本/下载选项和 rmarkdown::render 参数。渲染前需确认项目 knit_root_dir、R 和必要模板资源可用。

执行步骤

直接用法

• 在仓库根目录执行：
  • python3 skills/knit-rmd-html/scripts/knit_rmd_html.py <input>.Rmd
  • 输出默认写到 <input>.Rmd 同目录：<input>.html

常用参数

• 指定输出文件：
  • python3 skills/knit-rmd-html/scripts/knit_rmd_html.py <input>.Rmd -o <output>.html
• 指定 pandoc 版本（默认 3.8.3）：
  • python3 skills/knit-rmd-html/scripts/knit_rmd_html.py <input>.Rmd --pandoc-version 3.8.3
• 不自动安装依赖（只做检测；缺什么就报错）：
  • python3 skills/knit-rmd-html/scripts/knit_rmd_html.py <input>.Rmd --no-install
• 静默渲染输出：
  • python3 skills/knit-rmd-html/scripts/knit_rmd_html.py <input>.Rmd --quiet

设计要点（为何这样做）

• 不依赖 R 写脚本：外层用 Python 做编排与环境自检；真正的 knit 仍由 rmarkdown::render() 执行。
• 自动补齐 pandoc：若系统无 pandoc，自动下载安装到 ~/.local/pandoc/ 并将 ~/.local/bin 放到子进程 PATH 前面。
• 兼容 Windows ZIP：安全解压后递归寻找唯一的 pandoc / pandoc.exe，兼容根目录与 bin/ 布局并拒绝歧义结果。
• 输出编码稳定：Rscript 日志始终按 UTF-8 解码并保留真实退出码，不依赖 Windows 控制台 locale。
• 相对路径更稳：用 knit_root_dir=dirname(input)，确保 Rmd 内 source("xxx.R") 等相对路径在 knit 时仍可用。

工作原理

1. 环境检测：检查 pandoc 和 Rscript 是否在 PATH 中
2. 自动安装：若缺少 pandoc，根据平台自动下载对应版本到 ~/.local/pandoc/
3. 渲染执行：通过 R 的 rmarkdown::render() 执行 knit
4. 输出定位：默认输出到输入文件同目录，可通过 -o 参数指定

输出

成功时在同级目录生成与 Rmd 同名的 HTML，或写入由 -o 指定的输出文件路径；同时保留渲染日志、Pandoc/依赖诊断和任务工作区中的临时产物，不改变输入 Rmd。

输出管理

BenszAPI 任务工作区

校验

校验 Rmd 路径和项目根目录、Pandoc/R 依赖、knit_root_dir 与输出 HTML 存在性；渲染退出码为 0 且 HTML 可读取时才报告成功。

失败与恢复

Pandoc/R 缺失、引导下载失败、路径越界、渲染超时或 rmarkdown::render 返回非零时，保留日志和诊断输出并报告可复现命令；若产生部分输出，由用户按需清理或隔离后再修复依赖/参数重试。

约束

公共硬约束

本块由 docs/templates/skill-common-constraints.md 统一维护；每个 SKILL.md 的 ## 约束 必须逐字同步本块，不得在副本中改写公共规则。

• 任务需要落盘时，使用唯一的 ./.bensz-api/task-{yyyymmdd-hhmm}-{简短描述}/ 根目录；共享材料放入 shared/，Skill 专属材料放入该 Skill 的 input/、output/、log/。
• 正式交付物、源代码和正式计划按项目约定保存，不写入任务工作区；未经授权不覆盖、删除、迁移或远程写入。
• 项目维护变更检查 BAC 可用性并记录需求、AI 产出、工具结果、文件改动和验证摘要；BAC 只做过程审计，不替代署名、责任或合规判断。
• 不记录 API Key、访问令牌、密码、Cookie、环境/凭据文件、私有 Prompt、身份信息、本地用户名、主机名或不必要的大体积原始数据。
• 文件路径必须规范化并限制在授权项目范围内；外部 URL、子进程和网络访问遵循最小权限，防止路径遍历、SSRF 和命令注入。
• Skill 版本唯一记录在自身 config.yaml:skill_info.version；公开 API、协议、目录或配置变更同步文档与 CHANGELOG.md。
• bensz-collect-bugs 是一个 Agent Skill；仅将 Bensz Agent Skill 或 Bensz 基础设施本身的设计缺陷交给它。先脱敏写入 ~/.bensz-skills/bugs/，当前任务不中断，只有用户明确要求才公开上报，禁止直接修改用户已安装的 Skill 源码。