OneScience Primitives Resource

Primitive Unification Scope

This skill is the unified OneSkills primitive registry. A primitive is any reusable scientific capability that can be recalled, bound into a plan, handed to an executor, or used as planning evidence. Primitives may be first-party OneScience resources or third-party tools, packages, databases, services, datasets, workflow patterns, output formats, validation contracts, and execution templates.

Third-party tools can be primitives. Record the source through provider / provenance metadata and expose only distilled content through resource_retrieval_result; do not require a permanent bridge skill unless the provider needs its own retrieval backend, credentials, lifecycle, or access policy.

Use onescience-primitive-distiller when a new external scientific agent skill or third-party capability needs to be converted into primitive assets. This skill remains retrieval-only: it returns existing primitive content through the resource contract and does not perform distillation, migration, file creation, or script promotion itself.

When an application or workflow primitive depends on a specific primitive such as bio.tools.scanpy, expose that relationship through primitive_dependencies in the consumer metadata and mention the primitive_id in the consumer spec or workflow notes.

The preferred category set is open and includes models, components, datapipes, datasets, tools, databases, services, application, visualization, workflow-planning, contracts, and output-format. Preserve legacy category names when they already exist, and map aliases such as workflow to workflow-planning in retrieval output.

你负责从 skills/onescience-primitives/assets/ 中找到最相关的 OneScience 原语，通过范围判定、快速过滤和语义匹配进行召回。不生成实现方案、不改代码、不执行脚本。

强制协议

本技能的 assets/ 目录仅供本技能内部使用。调用方（orchestrator / coder / 其他技能）不得：

• 直接 Glob / Read 本技能 assets/ 下的文件来获取原语信息
• 绕过 resource_retrieval_request 直接消费原语的 metadata.json、spec.md、usage.md 等文件内容
• 在未收到或构造 resource_retrieval_request 之前，禁止阅读或引用 assets/ 下的任何文件

调用方必须通过 resource_retrieval_request → resource_retrieval_result 的完整闭环获取资源。

协议范围豁免：当调用方已构造合法的 resource_retrieval_request（包含 user_request 和/或 filters），并按本技能「召回流程」中的步骤执行资源检索时，调用方可以使用以下工具操作——这属于本技能召回逻辑的执行，不是违规的直接消费。豁免范围分为两级：

优先路径 —— catalog_search + catalog_resolve：

• 使用 catalog_search 工具（kind=primitive, domain=..., q=...）搜索原语
• 使用 catalog_resolve 工具（part=body/contract/location）获取 companions 和契约
• catalog_search 搜索的是 OneCode 内置 catalog（含 bundled seed 原语），不依赖本地文件系统

降级路径 —— 文件系统 Glob/Read（仅当 catalog_search 无结果且确认 skills/onescience-primitives/assets/ 目录在本地存在时使用）：

• 枚举候选集（步骤 2）：Glob 列出资源目录
• 快速过滤/语义匹配（步骤 3-4）：Read 各资源的 metadata.json
• 内容组织（步骤 7）：Read 命中资源的 spec.md、usage.md、workflow_planning.md 及经白名单校验的执行资产
• 命名直查（命名直查模式步骤 3-4）：Glob 搜索目录名、Read metadata.json

调用方仍然不得沿 matched_resources[].path 自由读取任意文件，不得在未构造请求的情况下随意浏览 assets/ 目录，不得消费未在 execution_assets 白名单中声明的脚本或文件。

当本技能被上游技能调用时，resource_retrieval_request 是输入控制消息，不是需要回显给用户的最终内容。本技能直接执行召回流程并返回 resource_retrieval_result。

原语资产目录

assets/
  <domain>/
    <category>/
      <resource_name>/
        metadata.json            ← 基础信息（name, type, domain, description, tags, version）
        spec.md                  ← 规格知识（架构、参数、依赖）
        usage.md                 ← 使用知识（启动示例、接口、限制）
        workflow_planning.md     ← 规划决策知识（时机、流程、约束）
        references/               ← 可按需读取的扩展知识；仅允许 metadata 声明的文件
        scripts/                 ← 可选受控执行资产；必须由 spec.md 的 # execution_assets 结构化白名单 白名单声明

当前 assets/ 顶层按 domain 组织，实际目录以仓库中的现状为准；当前可见的顶层 domain 包括：

• bio
• cfd
• climate
• matchem
• general

每个 domain 下的 category 目录可能不同，按实际存在的目录检索，不要求所有 domain 都具有同一套子目录。当前常见 category 包括：

• components
• models
• datapipes
• application
• visualization
• workflow-planning
• contracts
• databases
• output-format

召回流程

【检索路径优先级】：OneScience 原语资产可能存储在两处：

1. 数据库/Blob Store（通过 catalog_search + catalog_resolve 访问）：bundled seed 或已同步至 OneCode 内置 catalog 的原语。这是默认检索路径，优先级最高。
2. 本地文件系统（通过 Glob + Read 访问 skills/onescience-primitives/assets/）：通过 oneskills 安装器解压到磁盘的原语。这是降级检索路径，仅在路径 1 无结果且确认本地 assets 目录存在时使用。

强制规则：

• 执行召回时，必须先尝试路径 1（catalog_search），不得跳过。
• 仅当 catalog_search 返回空结果，且确认 skills/onescience-primitives/assets/ 目录在本地存在时，才回退到路径 2（文件系统 Glob/Read）。
• 回退到路径 2 后，命名直查和常规召回管道的文件系统操作规则（步骤 0-9）仍然适用。

本技能没有统一索引文件，原语信息以各资源目录下的 metadata.json 为主。因此必须先确定检索范围，再枚举该范围内的资源目录并逐个读取 metadata.json，不要凭目录名猜测。

【路径规范】：本技能所有 assets/ 目录的绝对路径为 skills/onescience-primitives/assets/。资源目录采用三层嵌套结构：<domain>/<category>/<primitive_name>/（如 bio/visualization/complex_structure_visualization/）。在以下步骤中，凡出现 assets/<domain>/ 或 assets/<domain>/<category>/ 等路径，均指代相对于仓库根目录的 skills/onescience-primitives/assets/<domain>/...。使用 Glob 搜索候选资源时必须使用 ** 递归模式（如 assets/bio/**/metadata.json），不得使用单层 * 导致遗漏嵌套子目录。使用 Read 工具访问资产文件时，必须拼接完整路径前缀 skills/onescience-primitives/，不得使用不包含此前缀的相对路径。

【命名直查优先】：在执行常规召回管道（步骤 0-6）之前，必须先检查是否满足命名直查条件。

命名直查模式

当调用方明确知道目标原语名称时，跳过召回管道，直接定位并返回该原语。

触发条件（同时满足以下两项时进入命名直查）： a. filters.keyword 中包含一个可识别的原语名称（如 complex_structure_visualization、alphafold3、openfold_data_pipeline 等——即 assets/<domain>/<category>/ 下的某个目录名） b. filters.domain 已明确指定（如 bio、cfd、climate、matchem）

命名直查执行步骤：

1. 从 filters.keyword 中提取原语名称候选（将关键词按下划线连接、去空格、去标点等规范化处理后，与目录名比对）
2. 优先使用 catalog_search：调用 catalog_search 工具（kind=primitive, domain=<filters.domain>, q=<从 keyword 提取的名称>）。若命中，直接使用 catalog_resolve 获取 body/contract，并跳转到步骤 6。
3. 回退到文件系统：若 catalog_search 未命中且确认 skills/onescience-primitives/assets/ 目录存在，则在 skills/onescience-primitives/assets/<filters.domain>/ 下递归搜索匹配的目录名（使用 Glob 搜索 skills/onescience-primitives/assets/<domain>/**/<name>/metadata.json，其中 <domain> 替换为实际 domain 值如 bio，<name> 替换为从 keyword 提取的目录名）。必须使用 ** 递归匹配，不得使用单层 *。
4. 若找到唯一匹配，直接读取该目录的 metadata.json；若找到多个匹配（跨 category），读取所有匹配并取 domain 和 keyword 语义最接近的一个
5. 若未找到匹配，回退到常规召回管道（步骤 0-6）
6. 命中后，直接跳转到步骤 7（组织内容），跳过步骤 0-6 的枚举、过滤、语义匹配和截断
7. 命名直查命中的资源在 why_matched 中标注 named_lookup，说明是通过名称直查而非语义匹配

重要约束：

• 命名直查是精确匹配辅助机制，不是语义搜索的替代品
• 若 keyword 同时包含多个候选名称，对每个名称分别执行直查
• 命名直查仍然遵守内容组织规则（步骤 7-9），包括执行资产白名单校验
• 命名直查不绕过强制协议：调用方仍需通过 resource_retrieval_request 发起，不得直接读取 assets

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常规召回管道

以下步骤仅在命名直查未命中时执行。

0. 优先使用 catalog_search：首先调用 catalog_search 工具（kind=primitive），传入 domain、keyword 等过滤条件。若返回非空结果，直接对结果项使用 catalog_resolve(part=body) 获取完整内容，跳过后续文件系统枚举步骤。仅当 catalog_search 无结果时，继续执行以下文件系统流程。

   判定 domain scope：先判断调用方是否通过 filters.domain 显式提供 domain。

   • 若 filters.domain 明确给出，则直接使用调用方提供的 domain，只检索对应的 skills/onescience-primitives/assets/<domain>/，且不要再读取 skills/onescience-primitives/references/domain_profile.md 做二次判断
   • 若 filters.domain 未提供、为空或不可靠，则必须先读取 skills/onescience-primitives/references/domain_profile.md，再结合 user_request 与 task_state_summary 按其中定义的领域信号进行回退判定
   • 回退判定结果若为 climate | cfd | matchem | bio | general，则只检索对应的 skills/onescience-primitives/assets/<domain>/
   • 回退判定结果若为 unknown，说明无法稳定路由到单一领域；此时允许检索 skills/onescience-primitives/assets/ 下全部 domain 目录，但输出中的 detected_domain 必须保持为 unknown
   • 当请求已路由到生信领域，且涉及生信工作流、模型/数据管线/应用选择或多候选资源取舍时，可读取skills/onescience-primitives/references/bio_profile.md文档作为召回提示；该文件只辅助候选排序和边界解释，不能替代 metadata.json 证据

1. 判定 category scope：根据 user_request、content_request、filters.keyword、task_state_summary 判断是否明确指定资源类别。

   • 若明确指定模型、组件、数据管线、应用、可视化规范、工作流规划、输出格式、契约或数据库/服务类资源，则只检索对应 category
   • 若未明确指定，则检索当前 domain scope 下全部实际存在的 category 目录
   • 【强制】可视化信号识别：当 user_request 或 filters.keyword 中出现以下任一信号时，必须将 visualization 纳入检索范畴：
     • 显式可视化词：可视化、visualization、visualize、visual、render、rendering
     • 三维结构渲染词：3D、三维、结构展示、structure view、interactive、交互式
     • 置信度着色词：pLDDT、PAE、confidence coloring、B-factor、chain coloring
     • 分子可视化工具名：PyMOL、3Dmol、MolStar、NGL、cartoon、ribbon、surface、stick
     • 结构文件格式（需渲染）：.pdb、.cif、.mmcif、.pse、.pml
     • 当上述任一信号出现时，即使主意图被判定为 model/datapipe/application，也必须将 visualization category 纳入检索范围，不可遗漏

2. 枚举候选集：在已确定的 domain/category scope 内，使用 Glob 递归搜索 skills/onescience-primitives/assets/<domain>/**/metadata.json（必须使用 ** 递归匹配，不得使用单层 *），得到完整候选集。从每个匹配路径中提取三层信息：domain（assets/ 后第一段）、category（domain 后第一段）、primitive_name（category 后第一段）。示例：路径 assets/bio/visualization/complex_structure_visualization/metadata.json → domain=bio, category=visualization, primitive_name=complex_structure_visualization。后续所有路径拼接必须保留完整的 <domain>/<category>/<primitive_name>/ 三层结构，不得省略中间 category 层。

3. 快速过滤：仅当 filters.keyword 提供了关键词时执行；结合目录名、metadata.json 的 name、domain、description 与 tags 排除明显不相关的资源。未提供关键词时跳过本步。

4. 语义匹配：遍历剩余每个候选资源的 metadata.json，对比 user_request 与 description 字段的语义相关性。

5. 上下文增强：结合 task_state_summary 进一步筛选和排序，但不能用上下文替代资源本身的证据。

6. 按匹配度排序并截断：按语义相关性排序，返回最相关的 5-8 个资源；没有强相关资源时返回空列表，不要凑数。

   • 【强制】多类别覆盖保障：当检索范围为全部 category（即未限定单一 category），且候选集中存在多个 category 的实际资源时，截断必须满足以下覆盖规则： a. 先按语义匹配度排序得到全序列表。 b. 从高到低选取前 5 个资源（保障核心语义匹配质量）。 c. 检查这 5 个资源是否覆盖了候选集中所有实际存在资源的 category。若某个 category 中的全部资源均未进入前 5，且该 category 中存在至少一个资源的语义匹配度不低于最高分的 60%，则从该 category 中取匹配度最高的 1 个资源追加到结果中（即使超出 5-8 范围也不得丢弃）。 d. 追加后结果总数不超过 10 个；若超过 10 个，按语义匹配度去掉末尾超出部分。 e. 追加的资源在 why_matched 中备注 category_coverage 标签，说明其被保留是因为类别覆盖而非纯语义排序。
   • 说明：此规则确保当查询信号隐含多类别需求（如"分析蛋白质结构预测结果并可视化"），visualization 类资源不会因 model/component 类资源在纯语义排序中得分略高而被截断丢弃。

7. 逐个组织内容：对每个命中的资源，按 content_request 分别读取并填充该资源的 content 字段：

   • 留空或 "摘要"：优先只读取 metadata.json，生成简短摘要，description 字段的关键信息不进行过度压缩
   • "使用说明"：读取 usage.md（若存在）
   • "规格说明"：读取 spec.md（若存在）
   • "工作流规划知识"：读取 workflow_planning.md（若存在）
   • "参考资料" / "扩展知识"：只读取 metadata.json 中 knowledge_assets 声明的 references/ 文件，并按主题组织返回
   • "完整内容"：读取 metadata.json、spec.md、usage.md、workflow_planning.md 及 knowledge_assets 索引；不得因为请求完整内容而自动返回全部参考文件或任意脚本
   • "完整参考资料"：在路径、大小和 SHA-256 校验通过后，读取 knowledge_assets 声明的参考文件；大文件按物化规则处理
   • 当且仅当 include_execution_assets: true 时，按以下子步骤物化受控执行资产： a. 读取命中资源的 spec.md，定位唯一的一级标题

   execution_assets。

   读取该标题后紧邻的第一个 yaml 代码块，并从根字段 execution_assets 获取白名单数组。

   不得从其他章节、自然语言、表格或 scripts/ 目录推测资产。 若章节不存在、代码块不存在、YAML 无法解析、根字段缺失或 出现重复 # execution_assets 标题，则视为白名单不可用。 b. 遍历白名单中的每一项资产声明，以 primitive 目录（即 skills/onescience-primitives/assets/<domain>/<category>/<resource_name>/）为基准拼接相对路径，得到资产的绝对磁盘路径。 c. 对每个资产执行： ① 检查文件是否存在。不存在时，该资产的 status 标记为 unavailable，reason 填 file_not_found，跳过后续校验。 ② 读取文件原始内容，计算 SHA-256 并与白名单中的 sha256 比对。不匹配时，status 标记为 failed，reason 填 sha256_mismatch（记录期望值与实际值），不返回该资产的内容，不挂载到结果。 ③ 校验通过后： - 若文件内容 ≤ 64 KiB，直接将原文填充到该资产的 content 字段，status 标记为 available。 - 若文件内容 > 64 KiB，将资产物化到当前工作区的 .onescience_assets/<primitive_name>/<version>/ 目录（保留原始文件名），status 标记为 materialized，materialized_path 填写物化后的绝对路径，content_size_bytes 填写文件字节数。content 字段留空。 d. 遍历完成后，汇总所有资产的状态摘要：统计 available、materialized、unavailable、failed 四类计数。 e. 即使部分资产不可用或校验失败，也必须返回可用/已物化部分，并在结果中附完整的逐资产状态列表。不得因单个资产失败而丢弃全部可用资产。 f. 全部白名单资产均不可用时，该资源的 execution_assets 仍返回，但每一项 status 均为 unavailable 或 failed，并在 limitations 中明确说明原因。

8. 【强制】检索依赖组件：当命中的资源为模型类型（models category 下的资源）且需要获取规格知识和使用知识时，必须执行以下步骤：

   • 读取该模型的 spec.md 文件，定位 # key_dependencies 部分
   • 提取所有列出的依赖组件名称（每行一个组件名）
   • 对于每个依赖组件，在同一 domain 的 components category 下检索对应的组件资源目录
   • 读取每个依赖组件的 spec.md（若存在）和 usage.md（若存在）
   • 将检索到的依赖组件信息作为 dependent_components 字段附加到该模型资源的输出中
   • 若某个依赖组件在 components 中不存在，在 limitations 中说明缺失的组件
   • 此步骤不可跳过：即使 content_request 为 "摘要"，也必须检索依赖组件并至少返回其基本信息（name、description）

9. 填充输出字段：按下方「字段取值规则」推导 detected_domain、task_intent、每个资源的 type，并按「质量要求」生成 why_matched、摘要形式的 content、limitations。

输入格式

resource_retrieval_request:
  user_request: <用户需求描述>
  task_state_summary: <当前任务状态摘要，可选>
  content_request: <内容需求，可选>
  include_execution_assets: <true | false，可选，默认 false>
  filters:
    domain: <领域过滤，可选>
    keyword: <关键词过滤，可选>

输出格式

与统一资源契约保持一致：

resource_retrieval_result:
  status: success | partial | failed
  query_summary: <需求摘要>
  detected_domain: <climate | cfd | matchem | bio | general | unknown>
  task_intent: <model | component | datapipe | application | tool | database | output-format | visualization | workflow | contract | mixed>
  matched_resources:
    - type: model_primitive | component_primitive | datapipe_primitive | application_primitive | tool_primitive | database_primitive | output_format_primitive | visualization_primitive | workflow_planning_primitive | contract_primitive
      path: assets/<domain>/<category>/<primitive_name>/
      name: <原语名称>
      why_matched: <匹配理由，1句话>
      limitations: <使用限制，1-2句话>
      content: <根据 content_request 组织的内容>

content 完整格式（仅当 content_request 为 "完整内容" 时）：

content:
  metadata: <metadata.json 内容>
  spec: <spec.md 内容>
  usage: <usage.md 内容>
  workflow_planning: <workflow_planning.md 内容>
  knowledge_assets:
    - path: <metadata.json 的 knowledge_assets 白名单中的相对路径>
      title: <参考资料标题>
      purpose: <该资料解决的问题>
      source: <来源文件或上游文档>
      sha256: <白名单声明的校验值>
      status: <available | materialized | unavailable | failed>
      content: <仅 status=available 且文件较小时填充原文>
      materialized_path: <仅 status=materialized 时填充物化后的绝对路径>
      content_size_bytes: <文件字节数>
  execution_assets:
    - path: < spec.md 的 `# execution_assets` 结构化白名单中声明的相对路径 >
      kind: <python_cli | template | javascript_runtime | license | other>
      media_type: <MIME type>
      sha256: <白名单声明的校验值>
      status: <available | materialized | unavailable | failed>
      reason: <unavailable/failed 时的原因，如 file_not_found | sha256_mismatch>
      content: <仅 status=available 且 ≤ 64 KiB 时填充原文>
      materialized_path: <仅 status=materialized 时填充物化后的绝对路径>
      content_size_bytes: <status=materialized 时填充文件字节数>
  execution_assets_summary:
    total: <白名单资产总数>
    available: <计数>
    materialized: <计数>
    unavailable: <计数>
    failed: <计数>

执行资产强制规则：

• 只有请求显式包含 include_execution_assets: true 时才能返回。
• 只允许 spec.md 的 # execution_assets 结构化白名单 中逐项声明的相对路径；拒绝未声明文件、绝对路径、.. 和路径穿越。
• 规范化后的路径必须仍位于当前 primitive 目录内。
• 返回前校验 SHA-256；不匹配时不返回该资产内容，逐资产标记 status: failed 及 reason: sha256_mismatch（记录期望值与实际值），但不应影响其他已通过校验的资产。
• 调用方只能消费 content.execution_assets，不得沿 matched_resources[].path 直接读取文件。
• 大文件处理：≤ 64 KiB 的文本文件直接内联到 content 字段；> 64 KiB 的文件（如 3Dmol.js ~150KB、HTML 模板 ~200KB）物化到工作区 .onescience_assets/<primitive_name>/<version>/ 目录，status 设为 materialized，通过 materialized_path 传递绝对路径。
• 状态汇总：必须同时返回 execution_assets_summary，便于调用方在不解析全部资产明细的前提下快速判断整体可用性。
• 部分失败不阻塞全部：只要至少有一个核心资产（如 render_complex_structure.py）available 或 materialized，结果 status 可为 partial 而非 failed，让调用方自行降级决策。

知识资产强制规则：

• references/ 只承载可阅读的领域知识、API 参考、方法说明、示例和来源材料，不承载默认可执行代码。
• 每个参考文件必须在 metadata.json 的 knowledge_assets 白名单中声明 path、title、purpose、source、sha256 和 media_type。
• 只允许相对于当前 primitive 目录的路径；拒绝绝对路径、..、未声明文件和路径穿越。
• 默认摘要和完整内容只返回参考资料索引；只有 content_request 明确请求 参考资料 或 完整参考资料 时才读取其正文。
• 参考资料返回前校验 SHA-256；失败时标记 status: failed，不得静默使用未校验内容。
• 参考资料与执行资产分开统计、分开授权；读取参考资料不会授予执行权限。

字段取值规则

输出中的枚举字段不能凭空填写，按以下规则从数据推导：

• domain scope 判定：先判断请求是否路由到单个 domain。
  • filters.domain 明确时优先使用，且一旦使用就不要再读取 domain_profile.md 进行二次判定
  • filters.domain 缺失时，必须读取 skills/onescience-primitives/references/domain_profile.md，按其中标准化规则将请求映射到 bio | cfd | climate | matchem | general | unknown
  • 目录路由值按当前 assets 顶层目录解释，如 bio | cfd | climate | matchem | general
  • 若回退判定为 unknown，则不路由到单个目录，而是检索全部 domain 目录并保持 detected_domain: unknown
• category scope 判定：按自然语言语义映射到 category 目录。
  • 模型 / model → models
  • 组件 / module / block / encoder / decoder → components
  • 数据管线 / datapipe / dataset / loader / preprocessing → datapipes
  • 应用 / app / toolkit / template → application
  • 输出格式 / docx / pdf / pptx / markdown / mermaid / report / slide → output-format
  • 可视化 / visualization / visualize / visual / render / rendering / 3D / 三维 / 结构展示 / interactive / 交互式 / pLDDT / PAE / PyMOL / 3Dmol / cartoon / ribbon / surface / stick / .pdb / .cif / .mmcif → visualization
  • 工作流规划 / planning / route / decision → workflow-planning
  • 若请求未明确 category，则检索当前 domain scope 下全部实际存在的 category 目录
  • 当 filters.keyword 中包含明确的可视化信号但 user_request 未直接体现时，仍须将 visualization category 纳入检索范围
• detected_domain：按标准化 domain 枚举输出 climate | cfd | matchem | bio | general | unknown。
  • 若 filters.domain 已明确提供，则优先使用该值作为检索路由依据；输出时仍需与命中资源的 metadata.json.domain 保持一致性
  • 若 filters.domain 缺失，则以 domain_profile.md 回退判定结果作为领域判断基线
  • 若命中结果跨多个不兼容 domain、或回退判定本身为 unknown、或资源证据不足以支撑单一领域，则填 unknown
• matched_resources[].type：优先由资源所在 category 与 metadata.json.type 共同推导。
  • models 下的 model → model_primitive
  • components 下的 component 或普通 module → component_primitive
  • datapipes 下的 datapipe → datapipe_primitive
  • application 下的 application → application_primitive
  • output-format 下的 output-format → output_format_primitive
  • visualization 下的 visualization → visualization_primitive
  • tools 下的 tool → tool_primitive
  • databases 下的 database → database_primitive
  • workflow-planning 下的 workflow-planning 或 workflow → workflow_planning_primitive
  • contracts 下的 contract → contract_primitive
  • 若 metadata.json.type 与目录语义冲突，优先采用更能反映资源用途的目录语义，并在 limitations 中说明
• task_intent：根据 user_request 的主要意图判断。
  • 需要完整模型能力时填 model
  • 需要组件、模块、算子或内部结构时填 component
  • 需要数据准备、数据处理、数据接口时填 datapipe
  • 需要模板、脚本集合、分析工具或交付应用时填 application
  • 需要文档、幻灯片或报告交付格式时填 output-format
  • 需要结构、数据或模型结果的视觉呈现规范时填 visualization
  • 需要契约、接口约束或对接规则时填 contract
  • 需要数据库、公共 API 或知识库检索约定时填 database
  • 需要工作流规划、路由、决策知识时填 workflow
  • 多种意图并存且无法归一时填 mixed

质量要求

• 命名直查优先：收到请求后，首先检查 filters.keyword 是否包含可识别的原语目录名。若满足命名直查条件（domain 已指定 + keyword 含目录名），必须优先执行命名直查，不得跳过直查直接进入常规召回管道。

• 命名直查命中后，直接跳转到内容组织步骤，不受语义排序和截断限制。

• 命名直查未命中时，回退到常规召回管道。

• 先判定 domain scope，再判定 category scope；不要跳过范围判定直接做全局模糊搜索。

• 调用方给出 filters.domain 时，必须直接使用该值路由，且不得再读取 domain_profile.md 做二次领域判断。

• 调用方未给出 filters.domain 时，必须先读取 skills/onescience-primitives/references/domain_profile.md 做回退判定。

• 回退判定为 climate、cfd、matchem、bio 或 general 时，只能搜索对应 domain 目录。

• 回退判定为 unknown 时，才允许搜索全部 domain 目录。

• 无明确 category 时必须搜索当前 domain scope 下全部实际存在的 category；有明确 category 时只搜索对应 category。

• 当检索范围为全部 category 且用户请求中隐含多类型需求时，必须执行多类别覆盖保障规则，确保 visualization、workflow-planning 等非主力 category 中的高匹配资源不会被 model/component 类资源完全挤占截断位置。

• 当 filters.keyword 包含可视化信号词但 user_request 语义较弱时，仍必须匹配 visualization category 并至少检查该 category 下是否存在匹配资源。

• 通过语义匹配 metadata.json 的 description 字段召回，不依赖额外索引文件。

• why_matched 说明 query 与 description 的对应关系（1句话）。

• 摘要模式下的 content 从 description 字段提取核心能力一段话。

• limitations 优先从 spec.md 或 workflow_planning.md 的约束部分提炼；若相关文件缺失，可根据 metadata.json 已知边界简要说明。

• 某些资源可能缺少 usage.md、spec.md 或 workflow_planning.md；若请求内容部分存在、部分缺失，可返回 status: partial，并在 limitations 中说明缺失项。

• 没有匹配资源时返回空 matched_resources: []，不编造资源。